CERPOP - Centre d'Epidémiologie et de Recherche en santé des POPulations
CERPOP, UMR 1295, unité mixte INSERM - Université Toulouse III Paul Sabatier



Séminaires scientifiques 2023

  • Jeudi 19 janvier : Assemblée générale du CERPOP.
  • 3 grands thèmes à l'ordre du jour : vie de l'unité, bilan scientifique, questions diverses.
  • 12h00-13h45, format hybride, visio Teams et petite salle du bâtiment B, Faculté de médecine, 37 allées J. Guesde, Toulouse.
Objectif


Objectif du séminaire : présentation de travaux de recherche ; présentation de résultats ; discussion d'articles ; discussion d'une problématique (y compris méthodologique).
Co-animation : Raphaële Castagné (EQUITY) @ et Sophie Desmonde (SPHERE) @
Déroulement : présentation suivi d'un temps de discussion. Point "Vie de l'unité" possible en fin de séminaire.
Qui : tout membre du CERPOP peut présenter, intervenir et participer.
Quand : 3ème jeudi du mois (modification possible) / de 12h30 à 13h30. (sauf précision autre horaire)
: format hybride : Faculté de médecine,  37 allées Jules Guesde, Toulouse : salle Bât.B, 1er étage ou salle Jacques Pous (sauf précision autre lieu) / visioconférence.

SÉMINAIRES SCIENTIFIQUES 2020-2025

2023
19 janvier : Assemblée générale du CERPOP.
Ordre du jour : vie de l'unité, bilan scientifique, questions diverses.

2022
Bilan séminaire 2022 :
- 9 séminaires
- 2 intervenants extérieurs / 7 intervenants internes
- 45 participants en moyenne (39 en visio / 51 en mixte)

15 décembre
Sciences Ouvertes : Plan national et initiatives régionales. Qu'en est-il pour la recherche en santé ? Présentation
Anne Cambon-Thomsen (équipe BIOETHICS) et Laurence Mabile (équipe EQUITY/BIOETHICS)

17 novembre
Présentation de l'équipe BIOETHICS

20 octobre
Présentation de l'équipe SPHERE

15 septembre
Présentation de l'équipe EQUITY
Présentation des questions et axes de recherche sur la construction des inégalités sociales de santé !
1)      Lifecourse et incorporation biologique
2)      Parcours de soins, maladies chroniques et cancers
3)      Chaines de causalité et méthodologie
4)      Recherche interventionnelle

15 juin
Séminaire des doctorant.e.s du CERPOP. Ma thèse en 300 secondes. Programme
En présentiel : Faculté de médecine, 37 allées Jules Guesde. De 9h30 à 12h30.
Organisation : Hélène Colineaux, Frédéric Balen et Camille Joannès (équipe EQUITY)

19 mai
Le registre des handicaps de l'enfant de Haute-Garonne (RHE31). Malika Delobel-Ayoub (équipe SPHERE). Lire

21 avril
Genre et Recherche en Santé : défis et perspectives. Catherine Vidal, neurobiologiste, directrice de recherche honoraire à l’Institut Pasteur. Catherine Vidal est membre du Comité d'Ethique de l'Inserm où elle co-dirige le groupe "Genre et Recherches en Santé". Elle est l'auteure du rapport 2020 du Haut Conseil à l'Egalité intitulé : "Prendre en compte le sexe et le genre pour mieux soigner : un enjeu de santé publique". Elle est membre de ONU Femmes France, de l'Association "Femmes et Sciences" et est co-directrice de la collection "Egale à Egal" aux éditions Belin.

17 mars
Inégalités sociales et COVID en France. Stéphanie Vandentorren, médecin épidémiologiste, chercheure au Centre de Recherche Inserm-Université de Bordeaux U1219 « Bordeaux population health », et coordinatrice du programme inégalité sociales et territoriales de santé au sein Santé publique France.

17 février 
Qualité de vie et participation des jeunes adultes avec paralysie cérébrale : projet SPARCLE. Nicolas Vidart, post-doctorant (équipe SPHERE - Axe handicap). Lire

20 janvier
AG "virtuelle".

2021
18 novembre
Valéry Ridde, directeur de recherche au Centre Population et Développement, une Unité Mixte de Recherche associant l’Université de Paris et l’Institut de Recherche pour le Développement, est responsable de l'axe Santé, vulnérabilités et relations de genre au Sud.
"La prise en compte des inégalités sociales de santé dans la formulation des interventions de lutte contre la pandémie de COVID-19 : analyses croisées au Canada, en France et au Mali (HospiCOVID)"

28 octobre
Le SNDS : Quoi ? Pourquoi ? Qui ? Comment ? Nadège Costa (équipe EQUITY) Lire

16 septembre
Concevoir, évaluer et implémenter des interventions qui favorisent l'implication des patients dans les soins de santé (empowerment et littératie en santé) tout en réduisant les inégalités sociales de santé. Marie-Anne Durand (équipe EQUITY) Lire

17 juin
Santé mentale et Infection par le VIH en Afrique de l’Ouest. Charlotte Bernard (Inserm U1219, Bordeaux) Lire

20 mai
Amélioration des méthodes d’évaluation de la prévention en population âgée. Nicola Coley (équipe Vieillissement - Axe MANTAIN) Lire

15 avril
Santé-Environnement & Santé-Travail : quand on en sait suffisamment pour agir...ou pas ! Sylvie Cassadou (CREAI-ORS Occitanie) Lire

18 mars
Actualités sur les vaccins COVID. Agnès Sommet (équipe SPHERE) autour de la vaccination au COVID.

18 février
L'aventure d'Artemisia, ou peut-on guérir le paludisme par les plantes ? Michel Cot, directeur de recherche à l'Institut de Recherche pour le Développement IRD.

21 janvier
Pour une analyse genrée des inégalités de santé: le Projet GENDHI (ERC). Visioconférence. Michelle Kelly-Irving (équipe EQUITY). Lire

2020
17 décembre
Séminaire / AG.

19 novembre
Evaluations éthiques des essais cliniques en France : les leçons de la pandémie 2020. Visioconférence. Bettina Couderc : IUCT-O : Département soins de supports, INSERM UMR 1027 BIOETHIC, présidente du CPPSOOM2. Lire

22 octobre
Fake-news en santé publique. Visioconférence. Valentin Walker : doctorant (équipe Vieillissement - Axe ARTERRE)

15 octobre
Séminaire des doctorants de l'UMR 1027. Visioconférence co-organisée par Gaelle Soriano (équipe Vieillissement - Axe MANTAIN) et Dibia Liz Pacoricona Alfaro (SPHERE). Lire

18 juin
Etude de cohorte prospective prédictive PSYCOV-CV. Visioconférence. Emilie Bérard (équipe Vieillissement - Axe ARTERRE)
Evaluation de l’impact des manifestations psycho-comportementales liées au confinement lors de la pandémie COVID-19 sur l’aggravation des facteurs de risque cardiovasculaire et la décompensation des maladies cardiovasculaires, en population générale française.

20 mai
Déterminants sociaux de l’épidémie Covid19 et conséquences sociales & psychosociales du confinement de la population: Le projet EPIDEMIC. Visioconférence. Michelle Kelly-Irving, Alexandra Soulier, Cyrille Delpierre (équipe EQUITY) et Florence Sordes (CERPPS - Université Toulouse Jean Jaurès)

16 avril
COVID-19. Visioconférence.
• Situation épidémique : que sait-on de l'épidémie à l'échelle internationale, en France? Quelles prévisions?  Sophie Desmonde. Lire
• Quelles questions se posent sur les déterminants de l'épidémie, de l'effet du confinement (impact sur la santé notamment) et du dé-confinement? Michelle Kelly-Irving, Raphaële Castagné, Cyrille Delpierre. Lire
• Situation épidémique : que sait-on de l'épidémie à l'échelle internationale, en France? Quelles prévisions?  Sophie Desmonde. Lire
• Point sur les traitements/vaccins: Analyse critique de l'étude de Raoult, l'essai Discovery, plasma, autres. Valériane Leroy. Lire
• Réflexion éthique incluant le projet sur le tracing des patients COVID+.  Emmanuelle Rial Sebbag. Lire
• Quel-les questions/projets de recherche en cours dans l'Unité  ? Tous

5 mars
Projet INSPIRE. Sandrine Andrieu (équipe Vieillissement - Axe MAINTAIN)

16 janvier
Intégrité scientifique : fondements et mise en œuvre. Anne Cambon-Thomsen, Emmanuelle Rial Sebbag, (BIOETHICS)
SÉMINAIRES SCIENTIFIQUES 2016-2020

Séminaires scientifiques 2016-2020 Lire

GROUPE SNDS - DONNÉES DE SANTÉ
2022-2023

Co-animatrices du groupe SNDS
Nadège Costa (EQUITY) @        
Cécile Conte (EQUITY) @

Membres du bureau restreint 
Axel Renoux (MAINTAIN)
Mélanie Araujo (SPHERE)
Michael Mounié (EQUITY)

Membres du groupe
Alexis Revet (SPHERE)   
Yolande Esquirol (ARTERRE)
Julie Dupouy (EQUITY)
Vladimir Druel
Yohan Vergés

OBJECTIFS
La connaissance des différentes thématiques de recherche de l'unité basée sur le SNDS.
Le partage d'expertise et de méthodes : aspects réglementaires, développement d'outils pour optimiser la gestion et le traitement des données.
La réponse aux questions posées par les utilisateurs via ce groupe ou la participation aux comités EGB organisés par la CNAM.
Archives I Compte rendus I Références
Réunion : 6 décembre 2022 Compte rendu
1 - Nadège Costa – Présentation du groupe.
2 - Actualités du SNDS – Mélanie Araujo.
3 - Présentation de travaux menées sur les données du SNDS (questions) – Michael Mounié : « Etude des parcours de soins des patients ≥75 ans, hospitalisés après une chute, par le prisme des données du SNDS » -
4 - Questions diverses.

Réunion : 28 octobre 2021.  Le SNDS : Quoi ? Pourquoi ? Qui ? Comment ? (Nadège Costa et Cécile Conte - équipe EQUITY).

Ce groupe a été mis en place en septembre 2018, avec une réunion mensuelle et la structuration de groupes de travail. Lire pages 16-18

 Actualités sur le SNDS. 20 juin 2019. Cécile Conte, Maryse Lapeyre-Mestre (équipe émergente) Lire

Hulier-Ammar E, Chioccarello A, Touche P, et al. Recherche sur données : aspects juridiques et éthiques à travers l’expérience de l’hôpital Foch. Médecine & Droit. Vol.2022, Issue 172. February 2022. Lire
GROUPE InterStats
PRÉSENTATION ET OBJECTIFS
Le groupe de travail InterStats a pour vocation de faciliter les interactions entre les différentes équipes de l'UMR 1027 INSERM. Il permet aux personnes exerçant une activité de statisticien (ou mathématicien) dans l'une des 5 équipes de l'unité d'échanger autour de leurs questions méthodologiques et travaux.
Ce GdT a été créé en mars 2012 par Grégory GUERNEC, qui en assure seul l’animation. (gregory.guernec@inserm.fr).

Objectifs :
  Revisiter les méthodes statistiques avancées mais pas toujours maitrisées par tous (les modèles mixtes, le bootstrap, les analyses longitudinales, de survie et bien d'autres …).
  Exposer et discuter de problématiques statistiques rencontrées par les participants.
  Présenter des nouvelles méthodes statistiques : quelles soient développées par des chercheurs de l'UMR1027 ou par des extérieurs. Son objectif est clairement de permettre à tous d'utiliser les méthodes statistiques les plus innovantes.
  Mettre à disposition des participants un dossier de partage libre d’accès : données bibliographiques, cours et tutoriels, logiciels et programmes, diverses productions issues des séances proposées.
2020-2022
8 septembre 2022
    Diffusion des actualités statistiques diverses/ partage d’informations (colloques, formations …)
    Questions méthodologiques éventuelles de participants à soumettre au groupe
    Paradoxe de Simpson, facteur de confusion et non-collapsibilité des mesures d’effet en épidémiologie (G. Guernec)
    Introduction à R Markdown (H. Colineaux)

24 mai 2021
    Rappel des objectifs du GdT et de son fonctionnement
    Tour de table de reprise : brève présentation des participants, réflexion autour des attentes de chacun concernant le GdT
    Diffusion des actualités statistiques diverses/ partage d’informations (colloques, formations …)
    Questions méthodologiques éventuelles de participants à soumettre au groupe
    Présentation de la macro SAS %TABLEN dédiée à l’élaboration rapide de tableaux descriptifs (C. Cantet)
    Paradoxe de Simpson, facteur de confusion et non-collapsibilité des mesures d’effet en épidémiologie (G. Guernec)
 
2016-2019

25 janvier 2019 Forêts aléatoires, corrélation et données fonctionnelles (P. Saint-Pierre - IMT)
Transfert de fonctionnalités du logiciel R++ sur tablette tactile (Y. Chellah, C. Castagnet, A.charkani - R++, the next step)

14 décembre 2018 Question méthodologique: Interprétation des résultats d’un modèle mixte selon le type de variable (C. Cantet – Eq. 1)
Intelligence Artificielle, Big Data et Machine Learning : Les enjeux de l’apprentissage statistique (G. Guernec)

16 novembre 2018 Question méthodologique: Filtrer selon un score prédictif biaise-t-il les analyses sur la population restante ? (A. Renoux – Eq. 1)
Inférence causal : Contrôle de facteurs de confusion et applications (B. Lepage – Eq. 5)

5 octobre 2018 Modèles mixtes à processus latents (suite):
Synthèse de l'article: "Normalized MMSE for assessing cognitive change in population-based brain aging studies” de V. Philipps (2014) (G.Guernec)
[Application] Effet du niveau d’étude sur l’évolution de la maladie d’Alzheimer dans le temps évaluée par le déclin cognitif (C. Cantet -Eq.1)

6 juillet 2018 Apports de l'inférence causale: Analyses contrefactuelles et introduction aux graphes acycliques dirigés (B. Lepage - équipe EQUITY)
Les modèles mixtes à processus latents: Introduction et théorie (G. Guernec)

18 mai 2018 Méthodes d'analyse factorielle (A. Beaumont - ORSMIP)
Les modèles mixtes à classes latentes (G. Guernec)

23 février 2018 Introduction à l'analyse de médiation (B. Lepage - équipe EQUITY)
Présentation d'une première version du logiciel R++ (C. Genolini - Zebrys)
 
8 décembre 2017 Introduction aux modèles conjoints: Les modèles à effets aléatoires partagés (G. Guernec)
Question méthodologique sur la généralisation du test KAPPA (V. Rousseau - Eq. Pharmacovigilance)
Bilan annuel 2017 (G. Guernec)

10 novembre 2017 Multiple testing for biology and medicine -Partie II (P. Neuvial - CNRS UMR 5219)

29 septembre 2017 Multiple testing for biology and medicine -Partie I (P. Neuvial - CNRS UMR 5219)
Question méthodologique portant sur la prise en compte de la non-réponse dans la modélisation de données longitudinales (S. Desmonde - Eq.SPHERE)

7 juillet 2017 Réflexion autour des fonctionnalités relatives à la fusion standard de BDD (G. Sauzeau - Zebrys)
Prise en compte des risques compétitifs dans les analyses de survie. PARTIE III: Le modèle de Fine & Gray (V. Garès - Eq.5)
Recherche d'un test global de comparaison de pourcentages moyens appariés (V. Rousseau - Eq. Pharmaco-vigilance)

30 mai 2017 Gestion des tests multiples: Prise en compte de la corrélation par permutation et application à la métabolomique (R. Castagné - Eq.5)
Gestion des tests multiples: Les comparaisons multiples de moyennes (G. Guernec)

7 avril 2017 Prise en compte des risques compétitifs dans les analyses de survie. PARTIE II: Les modèles "causes spécifiques" (V. Garès - Eq.5)
Problématiques et questions fonctionnelles en lien avec l’analyse factorielle (V. Ehlinger - Eq.Sphere)
Gestion des tests multiples: Compléments probabilistes et application en génomique (G. Guernec)

28 février 2017 Présentation du sujet de stage "Signes précoces d'atopie et inégalités sociales - Cohorte ELFE" (M.Berodier - Eq.5)
Gestion des tests multiples: Procédures de corrections et applications (V. Rousseau, C. Delarue-Hurault & M. Araujo - Eq. Pharmacovigilance)
InterStats en bref (V. Garès)

27 janvier 2017 Prise en compte des risques compétitifs dans les analyses de survie (V. Garès - Eq.5)
Entame d'un document de synthèse collaboratif sur la problématique des tests multiples (G. Guernec)
 
13 décembre 2016 Synthèse de l'article "Modelling recurrent events: a tutorial for analysis in epidemiology” de Leila Daf Amorim and Jianwen Cai (2015) (G.Guernec)
en réponse à la problématique sur les évènements récurrents.
Bilan annuel (V. Garès (Eq.5)  et G. Guernec)

25 novembre 2016 Présentation de la thèse "Genetic and epidemiological modelling of gastrointestinal parasitism in sheep” (M. Saccareau - PhD INRA Auzeville), Questionnements sur la façon d'appréhender la non-réponse liée  au seuil de détection de la charge virale" (M. Benghezal - Eq.2)
Questionnements autour de la problématique des tests multiples (C. Delarue / M. Araujo - Eq. PharmacoVigilance)

28 octobre 2016 Présentation de la thèse "Étude de consistance et applications du modèle Poisson-gamma: modélisation d'une dynamique de recrutement multicentrique." (N. Minois - PHd Eq.1)
Démonstration des fonctionnalités graphiques futures du logiciel R++ actuellement en projet (C. Genolini, MCF Paris Nanterre)

2 septembre 2016 Utilisation du serveur depuis l’exterieur (E. Gardies - ORSMIP)
Espace partagée statistiques (V. Gares)
Présentation d'une problématique associée à l’analyse d’évènements récurrents (H. Colineau - Eq.5)
Présentation de la thèse "Évaluation du coût de la maladie de Horton et de ses variations à l'aide de modèles
de type "Population Average Model" utilisant les "Generalised Estimating Equations" (GEE)(M. Mounie - Eq.5)
Modèles de type SIBLINGS, GEE et mixtes (V. Ehlhinger - Eq.2)

7 juillet 2016 Présentation du répertoire commun de diffusion des informations (V. Garès et G. Guernec)
Discussion autour de R studio (C. Chouquet - IMT)
Réflexion autour des « siblings models » (C. Delarue / M. Araujo - Equipe Pharmaco-vigilance),
Utilisation des outils Knitr et Sweave (V. Gares)

23 mai 2016 Reprise du groupe Interstats, objectifs et structures des séances (V. Garès et G. Guernec)