Animation scientifique ESSAI

CERPOP - Animation scientifique

PRÉSENTATION ET OBJECTIFS

• Le groupe de travail InterStats a pour vocation de faciliter les interactions entre les différentes équipes de l'UMR 1027 INSERM. Il permet aux personnes exerçant une activité de statisticien (ou mathématicien) dans l'une des 5 équipes de l'unité d'échanger autour de leurs questions méthodologiques et travaux.
• Ce GdT a été créé en mars 2012 par Grégory GUERNEC, qui en assure seul l’animation. (gregory.guernec@inserm.fr).

OBJECTIFS :
• Revisiter les méthodes statistiques avancées mais pas toujours maitrisées par tous (les modèles mixtes, le bootstrap, les analyses longitudinales, de survie et bien d'autres …).
• Exposer et discuter de problématiques statistiques rencontrées par les participants.
• Présenter des nouvelles méthodes statistiques : quelles soient développées par des chercheurs de l'UMR1027 ou par des extérieurs. Son objectif • est clairement de permettre à tous d'utiliser les méthodes statistiques les plus innovantes.
Mettre à disposition des participants un dossier de partage libre d’accès : données bibliographiques, cours et tutoriels, logiciels et programmes, diverses productions issues des séances proposées.
 

2016-2019

25 janvier 2019 Forêts aléatoires, corrélation et données fonctionnelles (P. Saint-Pierre - IMT)
Transfert de fonctionnalités du logiciel R++ sur tablette tactile (Y. Chellah, C. Castagnet, A.charkani - R++, the next step)

14 décembre 2018 Question méthodologique: Interprétation des résultats d’un modèle mixte selon le type de variable (C. Cantet – Eq. 1)
Intelligence Artificielle, Big Data et Machine Learning : Les enjeux de l’apprentissage statistique (G. Guernec)

16 novembre 2018 Question méthodologique: Filtrer selon un score prédictif biaise-t-il les analyses sur la population restante ? (A. Renoux – Eq. 1)
Inférence causal : Contrôle de facteurs de confusion et applications (B. Lepage – Eq. 5)

5 octobre 2018 Modèles mixtes à processus latents (suite):
Synthèse de l'article: "Normalized MMSE for assessing cognitive change in population-based brain aging studies” de V. Philipps (2014) (G.Guernec)
[Application] Effet du niveau d’étude sur l’évolution de la maladie d’Alzheimer dans le temps évaluée par le déclin cognitif (C. Cantet -Eq.1)

6 juillet 2018 Apports de l'inférence causale: Analyses contrefactuelles et introduction aux graphes acycliques dirigés (B. Lepage - Eq.5)
Les modèles mixtes à processus latents: Introduction et théorie (G. Guernec)

18 mai 2018 Méthodes d'analyse factorielle (A. Beaumont - ORSMIP)
Les modèles mixtes à classes latentes (G. Guernec)

23 février 2018 Introduction à l'analyse de médiation (B. Lepage - Eq.5)
Présentation d'une première version du logiciel R++ (C. Genolini - Zebrys)

8 décembre 2017 Introduction aux modèles conjoints: Les modèles à effets aléatoires partagés (G. Guernec)
Question méthodologique sur la généralisation du test KAPPA (V. Rousseau - Eq. Pharmacovigilance)
Bilan annuel 2017 (G. Guernec)

10 novembre 2017 Multiple testing for biology and medicine -Partie II (P. Neuvial - CNRS UMR 5219)

29 septembre 2017 Multiple testing for biology and medicine -Partie I (P. Neuvial - CNRS UMR 5219)
Question méthodologique portant sur la prise en compte de la non-réponse dans la modélisation de données longitudinales (S. Desmonde - Eq.SPHERE)

7 juillet 2017 Réflexion autour des fonctionnalités relatives à la fusion standard de BDD (G. Sauzeau - Zebrys)
Prise en compte des risques compétitifs dans les analyses de survie. PARTIE III: Le modèle de Fine & Gray (V. Garès - Eq.5)
Recherche d'un test global de comparaison de pourcentages moyens appariés (V. Rousseau - Eq. Pharmaco-vigilance)

30 mai 2017 Gestion des tests multiples: Prise en compte de la corrélation par permutation et application à la métabolomique (R. Castagné - Eq.5)
Gestion des tests multiples: Les comparaisons multiples de moyennes (G. Guernec)

7 avril 2017 Prise en compte des risques compétitifs dans les analyses de survie. PARTIE II: Les modèles "causes spécifiques" (V. Garès - Eq.5)
Problématiques et questions fonctionnelles en lien avec l’analyse factorielle (V. Ehlinger - Eq.Sphere)
Gestion des tests multiples: Compléments probabilistes et application en génomique (G. Guernec)

28 février 2017 Présentation du sujet de stage "Signes précoces d'atopie et inégalités sociales - Cohorte ELFE" (M.Berodier - Eq.5)
Gestion des tests multiples: Procédures de corrections et applications (V. Rousseau, C. Delarue-Hurault & M. Araujo - Eq. Pharmacovigilance)
InterStats en bref (V. Garès)

27 janvier 2017 Prise en compte des risques compétitifs dans les analyses de survie (V. Garès - Eq.5)
Entame d'un document de synthèse collaboratif sur la problématique des tests multiples (G. Guernec)
 

13 décembre 2016 Synthèse de l'article "Modelling recurrent events: a tutorial for analysis in epidemiology” de Leila Daf Amorim and Jianwen Cai (2015) (G.Guernec)
en réponse à la problématique sur les évènements récurrents.
Bilan annuel (V. Garès (Eq.5)  et G. Guernec)

25 novembre 2016 Présentation de la thèse "Genetic and epidemiological modelling of gastrointestinal parasitism in sheep” (M. Saccareau - PhD INRA Auzeville), Questionnements sur la façon d'appréhender la non-réponse liée  au seuil de détection de la charge virale" (M. Benghezal - Eq.2)
Questionnements autour de la problématique des tests multiples (C. Delarue / M. Araujo - Eq. PharmacoVigilance)

28 octobre 2016 Présentation de la thèse "Étude de consistance et applications du modèle Poisson-gamma: modélisation d'une dynamique de recrutement multicentrique." (N. Minois - PHd Eq.1)
Démonstration des fonctionnalités graphiques futures du logiciel R++ actuellement en projet (C. Genolini, MCF Paris Nanterre)

2 septembre 2016 Utilisation du serveur depuis l’exterieur (E. Gardies - ORSMIP)
Espace partagée statistiques (V. Gares)
Présentation d'une problématique associée à l’analyse d’évènements récurrents (H. Colineau - Eq.5)
Présentation de la thèse "Évaluation du coût de la maladie de Horton et de ses variations à l'aide de modèles
de type "Population Average Model" utilisant les "Generalised Estimating Equations" (GEE)(M. Mounie - Eq.5)
Modèles de type SIBLINGS, GEE et mixtes (V. Ehlhinger - Eq.2)

7 juillet 2016 Présentation du répertoire commun de diffusion des informations (V. Garès et G. Guernec)
Discussion autour de R studio (C. Chouquet - IMT)
Réflexion autour des « siblings models » (C. Delarue / M. Araujo - Eq. Pharmaco-vigilance),
Utilisation des outils Knitr et Sweave (V. Gares)

23 mai 2016 Reprise du groupe Interstats, objectifs et structures des séances (V. Garès et G. Guernec
 

PRÉSENTATION

• Ce groupe a été mis en place en septembre 2018, avec une réunion mensuelle et la structuration de groupes de travail.
• Lire pages 16-18

OBJECTIFS

•  La connaissance des différentes thématiques de recherche de l'unité basée sur le SNDS.
•  Le partage d'expertise et de méthodes : aspects réglementaires, développement d'outils pour optimiser la gestion et le traitement des données.
•  La réponse aux questions posées par les utilisateurs via ce groupe ou la participation aux comités EGB organisés par la CNAM.